Gtsummary と Tableone：研究用途の比較ポイント

研究で使う前に

新しいツールを増やすことではなく、根拠を追跡できる状態のまま研究時間を短縮することを重視します。

向いている人

臨床研究、疫学、生物統計、医学・生命科学分野で、Rを用いて記述統計表、ベースライン表、論文用の表を作成する研究者・解析担当者向けです。

最初の一歩

まず、作成したい表が「素早いベースライン表」なのか、「論文投稿や報告書向けに体裁を細かく整えたい表」なのかを明確にします。

さらに確認したい場合

このページでは研究判断に必要な要点を整理しています。詳細な背景や関連情報は元のページで確認できます。

安全に使う流れ

1解析データ、群分け変数、連続変数・カテゴリ変数の一覧を整理し、欠測値の扱いを事前に決めます。

2tableone で必要な要約統計が短時間で出せるか確認し、標準化差や群間比較など基本的な要件を満たすか見ます。

3gtsummary で同じ表を作成し、ラベル、脚注、p値、出力形式、論文用の整形がどこまで必要か比較します。

4最終的に、再現性、共同研究者との共有しやすさ、投稿先の表形式に合わせた調整のしやすさで選択します。

注意点

p値や標準化差の有無だけで選ばず、変数型、欠測値、カテゴリの並び、ラベルの扱いを確認してください。

論文用の体裁を後から大きく直す予定がある場合、出力後の手作業が増えない方法を選ぶ必要があります。

パッケージの既定設定に依存しすぎると、解析計画書や投稿規定と要約方法がずれることがあります。

根拠チェック

同じデータで両方の出力を作り、各変数の n、中央値、四分位範囲、割合、欠測数が一致するか確認します。

連続変数の要約方法、カテゴリ変数の表示、検定方法、標準化差の定義が研究計画と一致しているか確認します。

最終表をRスクリプトから再生成できる状態にし、手作業で編集した箇所が解析結果を変えていないか確認します。